ラガさん、はじめまして。
>タイトルコマンドのマスターランカーってアナザーモードの事ですよね？
ちょっと違います。
マスターランカーというのは、ゲーム開始時からアナザーモードになっている
状態です。
ですので、S1後のSP昇格時のアナザーモードとは別物です。
この場合、つまり本編からの引き継ぎだとスペシャルパーツは出てきません。
ちなみにマスターランカーは泣きが入る難易度です。
>ジェノサイドがでてこないです
既に武器所持上限の15個に達していたとか考えられます。
詳しい状況が分からないので、何とも言えません。
でもこのゲームは良くできていて、入手方法が2つ以上に設定されていることが
あって、ジェノサイドは他に「闇商人のバーナードから購入」可能です。
そちらから入手してみるのはどうでしょうか?
私もこのゲームが大好きです。
PSではダントツでプレイした時間が一番長いゲームです。
いつの日かPS2やPS3で新作が出ることを願っています。
PSPでリメイクというのも良いかもしれませんね。